El Fideicomiso Fondo Desarrollo Empresarial y Promoción de la Inversión (FIFODEPI) es un organismo auxiliar cuyo objeto principal es otorgar Apoyos Directos al Desarrollo Empresarial, a las Inversiones Estratégicas y a los Programas de Fomento, establecidos en la Ley de Desarrollo Económico Sustentable del Estado Libre y Soberano de Morelos y su Reglamento. 

El Fideicomiso Ejecutivo del Fondeo de Competitividad y Promoción del Empleo, es un fideicomiso destinado a financiar proyectos estratégicos en el Estado de Morelos que contribuyan al desarrollo económico y la competitividad, generando empleos de calidad. Su principal objetivo es autorizar y respaldar programas y proyectos sustentables que beneficien a diversas regiones del estado, fomentando su autosuficiencia y rentabilidad social.

El Consejo de Ciencia y Tecnología del Estado de Morelos promueve el desarrollo científico, tecnológico y la innovación en la entidad. Su objetivo es impulsar la investigación, la formación de talento especializado y la vinculación entre academia y sector productivo, para generar soluciones innovadoras que impulsen el crecimiento económico y social. Además, fomenta la divulgación científica y gestiona fondos para apoyar proyectos de investigación, con el propósito de fortalecer el ecosistema de ciencia y tecnología en beneficio de la sociedad.